革兰染色法的基础一般包括初染、媒染、脱色、复染等四个步骤。未经染色的细菌，由于其与周围环境折光率差别甚小，故在显微镜下极难区别。
经染色后，阳性菌呈紫色，阴性菌呈红色，可以清楚地观察到细菌的形态、排列及某些结构特征，从而用以分类鉴定。染色原理：通过结晶紫初染和碘液媒染后，在细菌细胞壁内形成了不溶于水的结晶紫与碘的复合物，再用95%乙醇脱色。
革兰氏染色的基础是对细菌细胞壁染色，染色时挑取的细菌最好是对数期，或者活跃的细菌，干燥火焰固定的时候，细菌已死亡，固定的目的是脱色、水洗的时候，你染色的细菌不至于被冲掉洗脱
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